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NeoSuite CADD于Web的新型藥物分子設(shè)計(jì)平臺(tái)
折 扣 率: 0
最后更新:2014-03-04
關(guān) 注 度:3076
生產(chǎn)企業(yè):創(chuàng)騰科技有限公司
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產(chǎn)品詳細(xì)介紹NeoSuite CADD v2.0
基于Web的新型藥物分子設(shè)計(jì)平臺(tái)


[PDF資料下載]
       NeoSuite CADD是北京創(chuàng)騰科技有限公司基于Pipeline Pilot信息整合平臺(tái)和Discovery Studio中的最新模擬方法,并結(jié)合國(guó)內(nèi)多個(gè)知名藥物研發(fā)課題組自主開(kāi)發(fā)的模擬工具和數(shù)據(jù)庫(kù),搭建了一個(gè)全中文的基于網(wǎng)頁(yè)的藥物分子設(shè)計(jì)平臺(tái)。與其它常見(jiàn)的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)和專業(yè)級(jí)別的分子模擬軟件相比,NeoSuite CADD是專門(mén)針對(duì)藥化實(shí)驗(yàn)人員開(kāi)發(fā),包含豐富實(shí)用的CADD工具,并以最簡(jiǎn)易便捷的方式提供人們使用和操作,滿足科研人員特別是藥化實(shí)驗(yàn)人員日常計(jì)算和研究的需要。



功能和特點(diǎn):
      NeoSuite CADD v2.0包含藥化實(shí)驗(yàn)人員常用藥物設(shè)計(jì)流程和工具,方便的文件輸入輸出功能,支持常用化學(xué)文件格式,支持網(wǎng)頁(yè)三維結(jié)構(gòu)的顯示和操作。當(dāng)前版本包含的主要功能特點(diǎn)如下:
☆簡(jiǎn)單的安裝操作:NeoSuite CADD v2.0在使用時(shí)直接使用瀏覽器來(lái)登錄使用,用戶無(wú)需安裝客戶端軟件,通過(guò)鼠標(biāo)的點(diǎn)擊和參數(shù)的設(shè)置,就能完成常用的藥物設(shè)計(jì)計(jì)算工作。



   ☆安全的用戶認(rèn)證:NeoSuite CADD v2.0允許添加/管理該系統(tǒng)的用戶帳號(hào)。使用時(shí),用戶可以使用自己的帳號(hào)進(jìn)行登錄,使用完需要注銷登錄。



   ☆方便的化合物管理:NeoSuite CADD v2.0可以讓每個(gè)使用人員擁有自己的化合物庫(kù)列表。用戶可新建化合物庫(kù)、刪除化合物庫(kù)和預(yù)覽化合物庫(kù),并對(duì)化合物庫(kù)進(jìn)行計(jì)算操作。



   ☆計(jì)算任務(wù)的選擇和使用:NeoSuite CADD v2.0提供超過(guò)30個(gè)常見(jiàn)的藥物設(shè)計(jì)計(jì)算工具,并按照功能分成三類,包括化學(xué)信息學(xué)工具、藥物設(shè)計(jì)工具和生物大分子工具,用戶可以方便點(diǎn)擊選擇任務(wù)和設(shè)置參數(shù),并顯示全中文的在線幫助信息。



  ☆化學(xué)信息學(xué)工具:提供了常見(jiàn)的化合物結(jié)構(gòu)處理工具和化學(xué)庫(kù)的構(gòu)建、分析、查詢、報(bào)告工具。例如結(jié)構(gòu)二維與三維轉(zhuǎn)化、類藥性五規(guī)則篩選、基于反應(yīng)的虛擬化合物枚舉、基于R基團(tuán)的虛擬化合物枚舉、生物等電體枚舉、聚類分析、SDF文件內(nèi)容查看和報(bào)告、結(jié)構(gòu)相似性檢索、結(jié)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn)化等。
   ☆藥物設(shè)計(jì)工具:提供了在藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的通用工具和一些特別設(shè)計(jì)的流程,可以滿足實(shí)驗(yàn)人員對(duì)于藥物設(shè)計(jì)的常見(jiàn)需求。例如ADME毒性和代謝產(chǎn)物預(yù)測(cè)、LogP等物化性質(zhì)計(jì)算、SAR分析報(bào)告、QSAR模型構(gòu)建和預(yù)測(cè)、藥效團(tuán)數(shù)據(jù)庫(kù)PCDB查詢和導(dǎo)出*、藥效團(tuán)篩選(包括多藥效團(tuán)反向找靶)、快速分子對(duì)接等。
   ☆生物大分子工具:提供在藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域通常涉及到的一些生物大分子處理工具,包括序列的BLAST查詢和比對(duì)、蛋白的結(jié)構(gòu)優(yōu)化和疊合、全自動(dòng)化蛋白同源模建等。

* 該計(jì)算任務(wù)可能需要購(gòu)買(mǎi)第三方軟件



          自定義類藥性五規(guī)則篩選                基于R基團(tuán)的虛擬化合物庫(kù)枚舉



         活性化合物庫(kù)的SAR分析報(bào)告             基于藥效團(tuán)的反向找靶功能



     快速分子對(duì)接功能(在線顯示三維結(jié)構(gòu))           QSAR模型的建立



        基于ClustalW算法的蛋白多序列比對(duì)             蛋白三維結(jié)構(gòu)疊合

關(guān)于NeoSuite:
      NeoSuite是北京創(chuàng)騰科技有限公司自主開(kāi)發(fā),用于藥物企業(yè)和研發(fā)機(jī)構(gòu)的藥物分子信息管理和智能分析系列產(chǎn)品工具包,包括NeoSuite CMS——化合物樣品管理系統(tǒng),NeoSuite CIMS——化學(xué)試劑庫(kù)存管理系統(tǒng),NeoSuite CADD——基于Web的藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)。
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